180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2176 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  32.87 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  37.21 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30.17 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  36.21 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.19 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  43.01 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  28.4 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  37.89 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  24.03 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.23 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  36.84 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  28.4 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  36.9 
 
 		 528 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  28.21 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  36.56 
 
 		 527 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.07 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  36.56 
 
 		 527 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  37.08 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.94 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.51 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  37.65 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  37.93 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28.38 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.94 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  35.71 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  31.93 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  37.65 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  31.93 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  36.9 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  30.43 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.51 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  28.16 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.78 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.78 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.48 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  37.23 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  22.45 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  35.09 
 
 		 527 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30.9 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  35.58 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  35.58 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.8 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  36.9 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  36.08 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  33.94 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  28.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  34.78 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  33.33 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  31.31 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  29.35 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  32.97 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  35.51 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  23.53 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  31.91 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0331  Abortive infection protein  38.46 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0520111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  39.33 
 
 		 511 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  31.46 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  27.18 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  38.1 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  31.46 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32.63 
 
 		 480 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  31.25 
 
 		 602 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  34.74 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  32.58 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  28.75 
 
 		 420 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  32.98 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  31.76 
 
 		 538 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  32.53 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  37.63 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  34.48 
 
 		 268 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  30.7 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  37.63 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  34.94 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  29.29 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.61 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  29.55 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  28.09 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  30 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>