117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2417 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  100 
 
 		 362 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 338 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  38.61 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  41.24 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.46 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  43.33 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  29.68 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  35.77 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  34.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  22.31 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  33.66 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  36.19 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  33.63 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  35.42 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  33.93 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  22.89 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  36.54 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  43.48 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  30.13 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  22.93 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  40.45 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 775 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  34.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  29.27 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  28.97 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  37.33 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  28.23 
 
 		 282 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.1 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  36.27 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  33.7 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  26.9 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  29.41 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  37.86 
 
 		 830 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  25.11 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  36 
 
 		 253 aa  49.7  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.14 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  30.99 
 
 		 602 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  35.71 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.53 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  34.21 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  33.96 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  32.03 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  30.4 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  27.45 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  33.77 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  38.27 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  39.19 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  28.87 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  37.11 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  29.85 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  27.39 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.71 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  27.39 
 
 		 249 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  26.75 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.75 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  26.75 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  33.78 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  36.17 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  28.81 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  35.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.75 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  28.16 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.97 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.75 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  30.61 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  32.22 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1494  abortive infection protein  36 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.81139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  37.65 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  29.73 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  28.16 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  32.69 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  36.36 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>