183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0988 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  95.24 
 
 		 273 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  48.48 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.98 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.54 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.04 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  28.02 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  31.58 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  36.36 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  34.83 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  35.71 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  36.19 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  32.35 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  27.33 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  35.96 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  28.7 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.52 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  32.46 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  30.68 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  38.2 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.68 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  32.52 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  35.96 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  32.71 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  44.16 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  28.23 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  30.99 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  28.12 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  32.61 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  33.64 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  30.68 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  38.27 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.02 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  29.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  40.96 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  24.1 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  23.81 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  36.11 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  30.68 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  33.73 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  25.33 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 527 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 527 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 527 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  32.95 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  31.18 
 
 		 528 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  30.11 
 
 		 538 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32.26 
 
 		 480 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  36.67 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  29.45 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  27.78 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  33.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  27.17 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  27.17 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  36.07 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  36.07 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  28.7 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  30.19 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  26.49 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  31.53 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  28.09 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  32.53 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  32.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  34.04 
 
 		 225 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.77 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  24.7 
 
 		 458 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  24.79 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  24.79 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  24.79 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  24.48 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  35.53 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  32.97 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>