64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0115 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 405 aa  809    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.92 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  25.16 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.53 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.24 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  25.09 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  20.71 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.7 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  27.76 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  21.53 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  26.97 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  26.97 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.11 
 
 		 830 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  25.15 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  27 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  26.14 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  26.14 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  26.64 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  25.76 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  25.76 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  26.64 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  22.13 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  20.05 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  20.78 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  24.32 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  22.62 
 
 		 775 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.78 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  30.83 
 
 		 274 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  21.3 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  21.29 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  19.73 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  26.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  19.74 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.19 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  28.97 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0456  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  50 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  35 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  22.66 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  47.92 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  44.9 
 
 		 275 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  22.66 
 
 		 278 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  52.5 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  22.66 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  22.66 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  54.29 
 
 		 271 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>