110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0518 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  44.94 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  42.53 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  40.62 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  42.11 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  33.6 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  41.11 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.14 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  33.48 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  40.48 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  35 
 
 
362 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  40.66 
 
 
311 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  37.8 
 
 
302 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  41.49 
 
 
775 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  32.58 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  36.63 
 
 
432 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.63 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  27.75 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0662  Abortive infection protein  37.97 
 
 
322 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  26.71 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  32.74 
 
 
267 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  33.02 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1789  hypothetical protein  33.52 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  30.47 
 
 
480 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  25.75 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  38.37 
 
 
227 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30.23 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  33.77 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  28.41 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  32.98 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  31.91 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  32.54 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  31.91 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  42.47 
 
 
538 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  31.19 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  36.05 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.97 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.6 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.43 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30.48 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  32.29 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  27.07 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  34.48 
 
 
287 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.97 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 
313 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  31.91 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  31.19 
 
 
308 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 
313 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  37.5 
 
 
527 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  37.5 
 
 
527 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  28.89 
 
 
288 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  29.79 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  31.43 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  27.84 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  33.72 
 
 
742 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  24.16 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.18 
 
 
399 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.67 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  27.36 
 
 
340 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  25.2 
 
 
176 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  29.67 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  34.52 
 
 
528 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  29.67 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  30 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  29.67 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  24.84 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  31.91 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  27.27 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.67 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  29.37 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  23.21 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  34.26 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  25.97 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  32.67 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  23.64 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  31.13 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  31.13 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  27.97 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.97 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  27.97 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  24.24 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.24 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  28.07 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  24.24 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  33.33 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  32.08 
 
 
602 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  21.82 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  25.93 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.26 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  23.64 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  33.05 
 
 
241 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 
235 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>