122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2395 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  100 
 
 
289 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  42.96 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  41.73 
 
 
287 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  39.23 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  33.57 
 
 
286 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  42.42 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  44.73 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  37.87 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  43.52 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  39.37 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  42.15 
 
 
281 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  41.92 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  42.93 
 
 
278 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  36.82 
 
 
296 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  42.21 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  35.98 
 
 
325 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  31.78 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.38 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  30.65 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  32.83 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  33.87 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  29.6 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  29.46 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  34.84 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  33.5 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  33.09 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  38.97 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  26.48 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  28.5 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  29.33 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  32.79 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  29.33 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  28.85 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  29.19 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  29.67 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  29.72 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  35.07 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  25.18 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  42.05 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  26.81 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  32.85 
 
 
233 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  44.94 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  44.94 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  42.7 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  42.7 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  42.7 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  29.55 
 
 
351 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  27.98 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  30.15 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  29.55 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  26.8 
 
 
433 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  36.21 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  40 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
182 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  33.33 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  30.15 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  38.04 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  38.2 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0868  Abortive infection protein  38.04 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  39.25 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  32.08 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  25.76 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.99 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  26.44 
 
 
528 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  29.29 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  29.41 
 
 
527 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  29.41 
 
 
527 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  31.53 
 
 
775 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  32.05 
 
 
292 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  26.36 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  32.26 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.26 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  29.2 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  27.59 
 
 
515 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  30.47 
 
 
396 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  24.19 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  24.19 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  28.34 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  25 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  22.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  36.67 
 
 
480 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  24.19 
 
 
337 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  24.19 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  32.58 
 
 
198 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.33 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  27.37 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  28.28 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.13 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5328  Abortive infection protein  29.03 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  32.63 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  23.39 
 
 
337 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  33.77 
 
 
538 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>