60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1850  CAAX amino terminal protease family protein  35.66 
 
 
263 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0460286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  29.72 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  30.66 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  35.34 
 
 
288 aa  62.8  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  32.41 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  29.41 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  18.32 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 
227 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  29.46 
 
 
298 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  26.4 
 
 
298 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  29.46 
 
 
298 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  27.94 
 
 
301 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  27.78 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
237 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  27.55 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.03 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  26.72 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  25.57 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  26.72 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  25.55 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  25.78 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  25.57 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  29.94 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  26.91 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  28.66 
 
 
278 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  24.16 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.91 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  38.75 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  30.77 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  25.38 
 
 
306 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1625  abortive infection protein  27.27 
 
 
414 aa  45.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0074  Abortive infection protein  28.09 
 
 
316 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.460326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  28.08 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  28.57 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  24.88 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  24.14 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  28.08 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  28.08 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  28.07 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  28.08 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  29.77 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30.39 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5145  CAAX amino terminal protease family protein  32.18 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  28.08 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  28.08 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  28.08 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  33.33 
 
 
180 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  29.21 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  30.05 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  23.81 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  34.44 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  34.44 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  28.99 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  33.33 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  28.48 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  26.06 
 
 
325 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  27.75 
 
 
278 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>