89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1293 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  100 
 
 
272 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  63.94 
 
 
272 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  63.94 
 
 
272 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  63.94 
 
 
272 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  48.34 
 
 
272 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  66.34 
 
 
272 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  66.67 
 
 
272 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  46.31 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  48.76 
 
 
281 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  38.43 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  42.98 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  45.21 
 
 
276 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  44.75 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  44.75 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  39.07 
 
 
285 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  41.67 
 
 
292 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  41.67 
 
 
292 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  45.21 
 
 
412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  41.33 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  35.92 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  36.32 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  36.87 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  38.86 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  34.32 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  36.87 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  41.01 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  41.01 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  40.55 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  34.31 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  30.74 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  36.45 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  31.02 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  37.93 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  34.21 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  36.9 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  37.93 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  36.36 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  35.63 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.23 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  35.43 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  37.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  31.9 
 
 
317 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  37.37 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  42.86 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  32.8 
 
 
396 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  22.27 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  29.23 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  30.97 
 
 
281 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6387  hypothetical protein  32.98 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  36.7 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  33.33 
 
 
528 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  28.21 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  30 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  38.75 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  27.04 
 
 
453 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  29.55 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  33.33 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  33.33 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  33.33 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.4 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  35.71 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  30.49 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  32.53 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  37.04 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  38.46 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.43 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  37.5 
 
 
197 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  37.5 
 
 
197 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  39.19 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  29.89 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  36.17 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  38.1 
 
 
319 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  28.04 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  31.91 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  34.62 
 
 
188 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  34.02 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  28.57 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.58 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.62 
 
 
237 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  34.88 
 
 
318 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>