80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2782 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  597  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  33.72 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  28.19 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  30.13 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  32.6 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  28.38 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  31.11 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  27.95 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  31.97 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  32.41 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  30.28 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  33.03 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  34.1 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  34.1 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  35.2 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  34.1 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  34.1 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  34.1 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  26.64 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  34.1 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  29.63 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.09 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  32.77 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  28.86 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  35.38 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  28 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  27.83 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  27.36 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  27.49 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  28 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  28 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  34.03 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  31.08 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  26.07 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  26.83 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  29.17 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  25.37 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  25.4 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  27.44 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  29.9 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  28.87 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3006  Abortive infection protein  28.85 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.969878  normal  0.541418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  29.55 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.59 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.9 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  28.02 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  27 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  25.15 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  25.68 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  28.87 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  27.5 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  27.34 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22120  CAAX amino terminal protease family  23.77 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  28.87 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  27.82 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.3 
 
 		 346 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  26.61 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  27.84 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  27.84 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  26.61 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  28.95 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  27.84 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  25.46 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  27.2 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  29.79 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  31.96 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  27.72 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  27.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0673  abortive infection protein  29.2 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>