59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2419 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  33.47 
 
 
344 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  38.78 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  35.67 
 
 
376 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  35.67 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  35.5 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  35.67 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  35.67 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  35.5 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  38.73 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  35.07 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  34.57 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  27.59 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  34.59 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  30.6 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  25 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  30.53 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  28.31 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  27.88 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  26.96 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  27.03 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  27.03 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  35.29 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  33.82 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  30.71 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  29.52 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  26.37 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  33.33 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  30.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  36.14 
 
 
241 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  29.08 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  27.11 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  29.73 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  28.68 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  33.33 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  31.51 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  30.23 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  25.91 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  25.91 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.48 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  32.67 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  28.91 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  28.65 
 
 
278 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  27.82 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  28.89 
 
 
278 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  31.21 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  27.88 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  26.51 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  28.46 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  31.25 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  26.92 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  25.78 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  36.47 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  34.38 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>