76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2854 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  100 
 
 		 272 aa  523  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 272 aa  523  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 272 aa  523  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  63.94 
 
 		 272 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  69.23 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  69.42 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  50 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  47.09 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  50.25 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  52.63 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  50.26 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  40.83 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  45.05 
 
 		 290 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  45.05 
 
 		 290 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  42.92 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  42.92 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  42.92 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  42.92 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  42.92 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  38.43 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  42.93 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  41.92 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  44.06 
 
 		 412 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  41.92 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  38.61 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  35.94 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  38.2 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  42.5 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  42.5 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  34.62 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  31.84 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  36.55 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  37.2 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  41.5 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  33.51 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  34.85 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  35.35 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  38.46 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  25.36 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  29.55 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  37.21 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  28.81 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  36.36 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  40 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  32.37 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  36.84 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  33.71 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  35.29 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  26.53 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  40.51 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  38.1 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  38.75 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  29.13 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  35 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  36.36 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.87 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.47 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.17 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.87 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.38 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  31.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  43.48 
 
 		 420 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  29.87 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  26.53 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  32.95 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  32 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  34.02 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  33.86 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  28.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>