42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4418 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  100 
 
 		 292 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  96.92 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  83.68 
 
 		 288 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  82.64 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  82.64 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  82.29 
 
 		 301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  65.54 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  65.54 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  75.56 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  63.67 
 
 		 412 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  53.09 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  50.81 
 
 		 266 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  49.6 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  45.62 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  50.21 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  45.99 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  33.48 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  40.91 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  42.33 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  42.92 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.22 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  39.2 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  42.93 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  42.93 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  42.93 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  37.5 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  35.64 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  38.94 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  41.75 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  33.77 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  34.34 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  34.34 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  32.52 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  33.68 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  36.36 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  34.58 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2561  metal-dependent membrane protease  27.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>