43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1390 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  100 
 
 
412 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  95.03 
 
 
302 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  95.03 
 
 
302 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  95.03 
 
 
302 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  95.03 
 
 
302 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  95.03 
 
 
302 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  95.17 
 
 
290 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  95.17 
 
 
290 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  62.92 
 
 
292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  63.67 
 
 
292 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  55.32 
 
 
285 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  68.08 
 
 
288 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  52.61 
 
 
266 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  66.67 
 
 
288 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  66.79 
 
 
301 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  67.05 
 
 
301 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  66.79 
 
 
301 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  51.79 
 
 
281 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  51.81 
 
 
265 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  51.43 
 
 
281 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  55.92 
 
 
263 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  34.11 
 
 
299 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  41.51 
 
 
272 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  38.55 
 
 
281 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  41.95 
 
 
272 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  44.06 
 
 
272 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  44.06 
 
 
272 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  44.06 
 
 
272 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  33.73 
 
 
273 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  38.64 
 
 
275 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  40.5 
 
 
276 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  44.02 
 
 
272 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  44.08 
 
 
272 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  41 
 
 
255 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  39.23 
 
 
252 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  32.79 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  33.16 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  32.09 
 
 
305 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  25.96 
 
 
298 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  30.77 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  41.58 
 
 
218 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  31.62 
 
 
280 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>