43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1834 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  100 
 
 		 263 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  53.05 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  58.8 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  58.8 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  54.29 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  53.44 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  51.41 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  51 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  51.76 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  55.98 
 
 		 412 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  48.05 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  47.74 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  51.81 
 
 		 288 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  53.52 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  53.91 
 
 		 301 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  53.91 
 
 		 301 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  40.09 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  38.21 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  39.02 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  40.48 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  42.35 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  40.1 
 
 		 272 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  38.73 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  38.74 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  36.36 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  39.9 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  39.9 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  39.9 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  41.75 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  42.03 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  34.18 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  33.67 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  32.61 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3006  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.969878  normal  0.541418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  30.3 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  42.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  36.56 
 
 		 396 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>