43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2015 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  80.23 
 
 		 265 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  50.4 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  50.81 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  52.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  52.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  52.05 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  52.21 
 
 		 412 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  53.05 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  46.9 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  50.39 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  47.67 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  47.67 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  46.9 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  42.41 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  43.68 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  36.77 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  36.53 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  38.73 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  37.08 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  38.69 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  37.76 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  40.1 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  40.1 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  40.1 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  32.14 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  37.14 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  32.39 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  37.14 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  29.85 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.77 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  26.47 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  29.57 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3591  CAAX amino terminal protease family protein  29.91 
 
 		 563 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  34.33 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>