63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  100 
 
 
255 aa  477  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  59.24 
 
 
252 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  39.81 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  41.41 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  41.29 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  40.3 
 
 
292 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
290 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
290 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  43.75 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  43.75 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  30.24 
 
 
299 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  38.58 
 
 
265 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  39.09 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  39.18 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  36.45 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  39.42 
 
 
412 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  32.8 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  36.86 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  31.75 
 
 
272 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  34.91 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  48.25 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  34.5 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  34.5 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  34.5 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  36.72 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  42.57 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  42.57 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  40.7 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  28.43 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  42.57 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  36.46 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  31.28 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  29.93 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  35.53 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  39.53 
 
 
452 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  35.53 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.54 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40.96 
 
 
420 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  39.73 
 
 
453 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  40.4 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  43.37 
 
 
420 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  40.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  43.66 
 
 
448 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  43.66 
 
 
448 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  32.84 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  38.36 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  33.78 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  39.73 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  34.48 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  33.33 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  42 
 
 
480 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  36.67 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  35.23 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  35.58 
 
 
300 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.86 
 
 
234 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  32.11 
 
 
234 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  35.06 
 
 
396 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>