41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5617 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  57.79 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  57.79 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  48.67 
 
 
266 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  55.43 
 
 
292 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  54.65 
 
 
292 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  58.7 
 
 
412 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  57.98 
 
 
288 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  52.7 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  55.51 
 
 
288 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  48.97 
 
 
265 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  57.49 
 
 
301 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  57.49 
 
 
301 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  45.16 
 
 
281 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  56.28 
 
 
301 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  45.16 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  39.17 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  39.07 
 
 
272 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  31.42 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  38.31 
 
 
273 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  36.77 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  41.04 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  38.38 
 
 
272 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  38.38 
 
 
272 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  38.38 
 
 
272 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  38.02 
 
 
275 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  41.98 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  36.26 
 
 
276 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  41.15 
 
 
255 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  34.17 
 
 
252 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  29.96 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  32.61 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  39.34 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35.14 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>