37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1056 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  37.66 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  34.63 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  30.54 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  34.15 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  31.79 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  33.03 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  33.03 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  33.03 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  33.03 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  33.03 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  33.66 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  33.66 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  48.25 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  34.54 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  41.32 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  31.82 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  27.03 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  37.6 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  35.33 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  38.83 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  38.83 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  38.83 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  31.2 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  35.92 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  32 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  28.05 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  30.39 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  38.24 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  31.12 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  30.41 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  27.81 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  37.61 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  30.66 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  29.47 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  38.46 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  26.09 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>