73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  97.43 
 
 
272 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  60.37 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  51.66 
 
 
272 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  62.36 
 
 
272 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  62.36 
 
 
272 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  62.36 
 
 
272 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  41.67 
 
 
273 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  46.52 
 
 
281 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  45.53 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  39.19 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  51.05 
 
 
276 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
290 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
302 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
290 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
302 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  45.98 
 
 
302 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
302 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  45.98 
 
 
302 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  42.72 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  42.34 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  40 
 
 
292 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  42.93 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  46.41 
 
 
412 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  39.92 
 
 
281 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  38.37 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  34.21 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  37.19 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  37.37 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  37.37 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  43.96 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  43.96 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  38.36 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  43.69 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  42.35 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  33.09 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  35.48 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  26.71 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  32.65 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  44.94 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  32.89 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  35.29 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  32.39 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.11 
 
 
292 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  43.66 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  36.05 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  33.33 
 
 
286 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32.94 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  35.9 
 
 
188 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  44.05 
 
 
420 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.46 
 
 
396 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  30.19 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  32.18 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  41.38 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6387  hypothetical protein  31.47 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  43.04 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  40 
 
 
321 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  36.59 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  29.49 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  35.48 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  34.48 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  38.64 
 
 
193 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  28.83 
 
 
317 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1579  Abortive infection protein  26.98 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.468328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
188 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
187 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
170 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>