69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2685 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  100 
 
 		 252 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  58.66 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  45.21 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  45.21 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  37.37 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  37.37 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  38.73 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  39.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  39.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  39.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  39.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  40.1 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  39.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  40.1 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  39.71 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  33.06 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  38.38 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  38.27 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  38.27 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  38.27 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  34.83 
 
 		 281 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  36.32 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  37.19 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  34.34 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  36.68 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  37.32 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  33.47 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  39.29 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  35.75 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  31.68 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  32.27 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  33.17 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  36.5 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  27.72 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  37.68 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  37.68 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  37.5 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  39.25 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  39.42 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  43.68 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  39.77 
 
 		 452 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  36.84 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  32.67 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  29.2 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  37.18 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  39.39 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  39.39 
 
 		 448 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  41.77 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40.23 
 
 		 420 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  36.89 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  60.53 
 
 		 318 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  35.79 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  25.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  34.62 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  33.64 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  38.46 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  35.11 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  38.89 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  34.67 
 
 		 453 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  42.68 
 
 		 120 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  38.64 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  36.56 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  32 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.85 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  43.9 
 
 		 282 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  35.56 
 
 		 287 aa  42  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>