39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5779 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  100 
 
 
301 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  97.34 
 
 
301 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  97.34 
 
 
301 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  82.29 
 
 
292 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  82.29 
 
 
292 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  86.46 
 
 
288 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  75.69 
 
 
288 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  66.79 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  66.79 
 
 
290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  66.04 
 
 
412 aa  278  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  51.92 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  46.9 
 
 
266 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  50.53 
 
 
281 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  50.18 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  52.89 
 
 
263 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  46.51 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 
299 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.42 
 
 
272 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  40.29 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  43.87 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  43.87 
 
 
272 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  36.9 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  41.09 
 
 
272 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  41.09 
 
 
272 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  41.09 
 
 
272 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  40.2 
 
 
275 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  34.33 
 
 
273 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  42.19 
 
 
255 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  38.69 
 
 
252 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  37.69 
 
 
276 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  33.82 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  33.82 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  32.52 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  31.82 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>