126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2226 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  42.75 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  40.6 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  48.1 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.82 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  38.36 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  37.96 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  40.78 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  42.5 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  42.5 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  42.5 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  41.18 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  37.1 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  37.1 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  33.48 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  33.04 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  32.67 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  37.21 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  35.48 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  31.42 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  35.61 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  40.28 
 
 		 263 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  37.5 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  32.55 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  33.49 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  36.71 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  36.71 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  36.23 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  28.42 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  29.95 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  29.95 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  35.92 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  26.37 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  44.74 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  29.46 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  35.29 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  36.59 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  37.36 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  34.78 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  33.75 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  31.52 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  36.14 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  34.21 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.67 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  34.21 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  39.51 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  34.18 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  34.21 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  34.88 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  34.21 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  33.68 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.4 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.68 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.34 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  34.94 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  38.03 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  30.07 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.46 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  31.58 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  33.33 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.34 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.94 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  28.72 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.46 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.34 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  34.18 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  29.07 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.46 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  32.69 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 		 376 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  32.53 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  31.82 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  32.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  32.22 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  28.87 
 
 		 259 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  33.33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  40.54 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  32.53 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.1 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1080  abortive infection protein  32.05 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.89 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>