142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1880 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  100 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  79.57 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  30.99 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  36.84 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.05 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  45.26 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  36.19 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  31.75 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  30.86 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  32 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  32 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  32.62 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  37.86 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  39.81 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  28.89 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  41.18 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  25.15 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  30.82 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  26.32 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  33.13 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  31.41 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  26.32 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.3 
 
 		 480 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  32.73 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  26.32 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  30.61 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  35.81 
 
 		 528 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  31.92 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  42.11 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  33.13 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  37.29 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  26.11 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  34.92 
 
 		 453 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  36.46 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  30.11 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  36.46 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2845  Abortive infection protein  44.12 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.957668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  37.63 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.59 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.42 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  37.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  32.28 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  35.48 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  37.23 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  35.42 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  36.61 
 
 		 453 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  31.25 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  38.89 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  42.11 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  33.68 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  34.38 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  36.36 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  25.81 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  35.96 
 
 		 775 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  33.68 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  34.95 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  26.04 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  36.08 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.68 
 
 		 420 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  31.71 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  38.46 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  38.14 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2561  metal-dependent membrane protease  25.88 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1477  Abortive infection protein  34.69 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  35.16 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0006  abortive infection protein  28.46 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  34.48 
 
 		 515 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  31.15 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  27.85 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  37.37 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  31.25 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  34.02 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  28.33 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  33.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  33.96 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0006  hypothetical protein  29.09 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  27.27 
 
 		 203 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  31.96 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  31.96 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  35.14 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  32.61 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.78 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  34.19 
 
 		 448 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  35.92 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>