40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3240 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  42.86 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  27.51 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  28.38 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  36.25 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  32.48 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  32.48 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  31.25 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  36.05 
 
 
299 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  34.65 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  36.59 
 
 
294 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  30.84 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0175  Abortive infection protein  29.19 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  35.05 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  30.49 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  33.33 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  24.31 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1074  abortive infection protein  33.72 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  24.31 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  24.31 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  30 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  27.2 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  24.31 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1685  Abortive infection protein  31.82 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171064  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  22.92 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  36.59 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1602  abortive infection protein  32.56 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  22.87 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  24.09 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  33.33 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  29.76 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0873  abortive infection protein  31.4 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  26.13 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  29.21 
 
 
338 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  32 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  35.79 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  28.57 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  36.36 
 
 
253 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0941  abortive infection protein  32.53 
 
 
172 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  34.25 
 
 
273 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>