52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1534 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  100 
 
 
120 aa  233  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  42.86 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  32.11 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1506  Abortive infection protein  42.39 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0652668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1685  Abortive infection protein  41.76 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171064  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  30.3 
 
 
236 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  30.3 
 
 
236 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  35.48 
 
 
256 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  30.3 
 
 
236 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  29.29 
 
 
237 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2748  abortive infection protein  29.36 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  31.18 
 
 
273 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  29.29 
 
 
237 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  33.33 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  35 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  35.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  37.21 
 
 
259 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.35 
 
 
241 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  34.41 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  34.41 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  34.41 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  30.19 
 
 
267 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  31.73 
 
 
296 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  28.87 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  34 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  31.87 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  31.15 
 
 
265 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  42.68 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  33.67 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  32.22 
 
 
299 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 
267 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  28.75 
 
 
251 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  31.46 
 
 
246 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.33 
 
 
362 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  28.3 
 
 
269 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  32 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  30.77 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  42.03 
 
 
272 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  28.57 
 
 
272 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  29.51 
 
 
265 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  43.48 
 
 
289 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  34.52 
 
 
238 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  27.96 
 
 
292 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>