55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1315 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  86.54 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  59.84 
 
 		 282 aa  284  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  53.78 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  53.85 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  53.85 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  53.69 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  51.65 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  50 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  51.18 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  51.03 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  50.42 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  45.6 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  43.78 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  50.41 
 
 		 437 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  46.91 
 
 		 296 aa  184  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  42.86 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  42.04 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  42.34 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  40.96 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  43.8 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  41.43 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  41.8 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  40.16 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  41.06 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  43.04 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  44.98 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  40.16 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  40.16 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  39.3 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  41.43 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  41.43 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  39.92 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  37.29 
 
 		 302 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  35.06 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  34.29 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  29.07 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  27.72 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  27.56 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  28.57 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.61 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  32.32 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.61 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25.43 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  29.76 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.52 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.61 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  32.32 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>