55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1923 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  100 
 
 
232 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  34.94 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  30.8 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  31.25 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  32.74 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  34.83 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  32.48 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  37.65 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  33.66 
 
 
294 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  39.02 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  26.7 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  34.09 
 
 
346 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  30.06 
 
 
308 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  32.77 
 
 
308 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  26.4 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  35 
 
 
120 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.32 
 
 
337 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31.39 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.87 
 
 
337 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  38.16 
 
 
420 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  32.32 
 
 
337 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  32.32 
 
 
337 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.87 
 
 
337 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  29.69 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  31.2 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.76 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  32.32 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  32.32 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  33.73 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  33.73 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  33.73 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  33.73 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  36.14 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  26.98 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  28.03 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30.59 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  30.7 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  30.7 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  34.18 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.71 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  35.63 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  39.19 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  35.63 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  35.35 
 
 
775 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  39.19 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  38.46 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  26.58 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0249  Abortive infection protein  36.84 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  38.75 
 
 
264 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  32.1 
 
 
288 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  35.96 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  26.19 
 
 
273 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  37.21 
 
 
527 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  37.21 
 
 
527 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>