43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0216 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  100 
 
 
277 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  55.82 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  53.94 
 
 
241 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  48.71 
 
 
267 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  47.2 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  48.8 
 
 
256 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  47.29 
 
 
256 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  47.64 
 
 
282 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  48.57 
 
 
255 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  48.8 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  45.08 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  42.8 
 
 
264 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  47.13 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  46.12 
 
 
269 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  44.68 
 
 
263 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  46.72 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  46.72 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  44.19 
 
 
268 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  44.19 
 
 
268 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  45.76 
 
 
437 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  42.56 
 
 
273 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  45.08 
 
 
268 aa  178  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  44.48 
 
 
296 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  45.63 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  41.22 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  42.86 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  45.12 
 
 
253 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  44.54 
 
 
269 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  43.09 
 
 
259 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  45.18 
 
 
242 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  40.37 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  44.88 
 
 
272 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  51.19 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  37.74 
 
 
295 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  31.65 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  30.8 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.68 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  32.22 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  28.95 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.33 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  32 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  30.19 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  34.69 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>