49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5401 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  94.88 
 
 
264 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  94.09 
 
 
257 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  77.11 
 
 
255 aa  363  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  72.29 
 
 
256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  73.2 
 
 
259 aa  341  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  73.2 
 
 
259 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  73.2 
 
 
259 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  51.11 
 
 
264 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  50.39 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  51.79 
 
 
268 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  48.95 
 
 
241 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  44.53 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  44.53 
 
 
256 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  46.34 
 
 
256 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  42 
 
 
282 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  45.16 
 
 
286 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  39.52 
 
 
260 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  44.9 
 
 
253 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  42.63 
 
 
269 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  43.32 
 
 
273 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  42.55 
 
 
293 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  38.22 
 
 
258 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  41.53 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  56.33 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  41.08 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  40.16 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  40.68 
 
 
296 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  42.5 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  42.92 
 
 
242 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  43.87 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  40.54 
 
 
437 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  36.33 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  34.74 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  34.21 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.34 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  39.24 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.66 
 
 
242 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0170  abortive infection protein  27.04 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  36.73 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  30.07 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  37.5 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  25.51 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  34.67 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  34.44 
 
 
360 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.32 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  35.63 
 
 
232 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  35.53 
 
 
234 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>