183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0716 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  34.26 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  36 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  37.82 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  39.25 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  39.25 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  38.32 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  38.32 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  35.04 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  37.38 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  37.38 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  36.45 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  38.32 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  36.45 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  36.45 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.81 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  35.04 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  34.19 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.19 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.19 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  34.19 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  34.38 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  32.71 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  25.71 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  30.4 
 
 
256 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.29 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  33.33 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  36.67 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  36 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.51 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  35.87 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  40 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  35.87 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  35.79 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  40.24 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  34.62 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  41.46 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.67 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  36.47 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  36.63 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  28.83 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  41.77 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  36.25 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  36.08 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  28.7 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  34.18 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  41.46 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  34.38 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  33.33 
 
 
196 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  34.09 
 
 
210 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  40.23 
 
 
180 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  41.77 
 
 
224 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  41.77 
 
 
236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  41.77 
 
 
236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  35.56 
 
 
237 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  31.25 
 
 
279 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  31.46 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  41.77 
 
 
236 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  34.52 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  27.97 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  30.7 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  29.03 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  28.83 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  32.94 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  33.01 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  34.44 
 
 
396 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  24.81 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  30.77 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  33.01 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  33.33 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  31.34 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  34.12 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  34 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  32.29 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  34.44 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  30.13 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  30.13 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  30.13 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  30.13 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32.14 
 
 
480 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  31.4 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  30.95 
 
 
527 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  34.57 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  30.59 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  32.58 
 
 
538 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  30.13 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  28.7 
 
 
130 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0732  metal-dependent membrane protease  28.57 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  30.95 
 
 
527 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  31.18 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  29.59 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>