167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1871 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  535  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  81.75 
 
 		 292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  81.82 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.78 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  39.58 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  39.58 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  39.58 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  39.58 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  39.58 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  39.58 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  37.78 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  35.56 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  33.72 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  38.71 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  33.72 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.94 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  32.99 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  40.48 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  37.65 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.94 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  32.04 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  38.2 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  32.73 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  28.93 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  22.65 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  28.42 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  30.77 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  28.57 
 
 		 197 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  29.2 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  29.37 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  35.9 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  35.64 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  29.23 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  31.68 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  31 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  29.03 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  31.31 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  34.09 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  31.18 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  35.23 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  31.87 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  28.74 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.76 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  38.96 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.59 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  33.33 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  31.31 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  32.99 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  32 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  31.11 
 
 		 193 aa  49.3  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  31.91 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  30.23 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  30.21 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  38.96 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  32.99 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  29.55 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  30.66 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  27.47 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  30.23 
 
 		 528 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.71 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  28.4 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  26.04 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  30 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0074  Abortive infection protein  32.43 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.460326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  30.85 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  27.01 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  33.71 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.46 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  30.19 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  35.29 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  23.21 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  30.93 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.34 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  31.33 
 
 		 480 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  25.24 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>