137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2118 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  38.51 
 
 
234 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  38.22 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  36.63 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.88 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.88 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.88 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  26.88 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  39.53 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  39.53 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.58 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.25 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  37.31 
 
 
448 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  37.31 
 
 
448 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  32.84 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  35.85 
 
 
420 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  37.76 
 
 
538 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  27.91 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  33.7 
 
 
528 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.61 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.84 
 
 
312 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  38.71 
 
 
527 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  36.56 
 
 
511 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07541  membrane-associated protease  37.25 
 
 
435 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  32.35 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  27.91 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  35.35 
 
 
453 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  35.29 
 
 
515 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  28.83 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  26.06 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  35.29 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  33.02 
 
 
420 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  37.35 
 
 
480 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  26.51 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  29.89 
 
 
292 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
267 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.46 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  33.77 
 
 
453 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  28.57 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  29.66 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  30.92 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  28.74 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  28.66 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  35.62 
 
 
453 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  32.58 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.33 
 
 
362 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  27.21 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.11 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
288 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  37.23 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  26.44 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  30.83 
 
 
321 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  24.71 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.02 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34.02 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  28.83 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  32.71 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  27.59 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  29.41 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  27.59 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  27.55 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  30 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  28.57 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  32.41 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  31.36 
 
 
225 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  34.09 
 
 
226 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  27.18 
 
 
292 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32.08 
 
 
399 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  30.38 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  26.26 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  31.36 
 
 
203 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  27.01 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.33 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.79 
 
 
313 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  32.99 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  28.08 
 
 
311 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  32.67 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  27.18 
 
 
273 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1457  Abortive infection protein  26.14 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  34.12 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  34.12 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  29.27 
 
 
130 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  29.87 
 
 
452 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  25.29 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.14 
 
 
308 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  27.54 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>