47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1934 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  35.71 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  28.7 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  30.28 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  27.11 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.87 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 337 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  28.85 
 
 		 313 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.59 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.59 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  28.85 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  28.87 
 
 		 337 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.9 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 		 337 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  29.29 
 
 		 775 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  34.04 
 
 		 329 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  22.61 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  33.7 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0359  abortive infection protein  33.98 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.716019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  28.87 
 
 		 308 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  31.87 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  40.43 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0309  hypothetical protein  31.52 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  32.46 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  25.73 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  27.88 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34.74 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  29.41 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.74 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  34.12 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  32.14 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  26.44 
 
 		 308 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  32.14 
 
 		 282 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  26.37 
 
 		 343 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  29.87 
 
 		 282 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  28.23 
 
 		 336 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>