80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  100 
 
 		 254 aa  490  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  27.75 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.91 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  28.44 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.36 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  37.21 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  37.76 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.74 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  29.41 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  29.46 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  30 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  35.09 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  33.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  32.08 
 
 		 374 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.93 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  38.36 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  36.14 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.49 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  34.88 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  27.59 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  22.56 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.49 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  30.3 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  33.72 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  27.78 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  34.15 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  33.8 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  51.22 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  24.31 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  22.56 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  22.9 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  26.47 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  22.56 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  30.59 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.1 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  22.56 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  36.26 
 
 		 372 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  22.56 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  33.71 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  30 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0437  Abortive infection protein  30.59 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  33 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  31.18 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  32.58 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  28.89 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  28.36 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  23.91 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  29.49 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  44 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1797  CAAX amino terminal protease family protein  29.81 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40 
 
 		 420 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  32.58 
 
 		 538 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  32.58 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  36.26 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  29.73 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  34.18 
 
 		 458 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  38.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  36.96 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  31.12 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  34.52 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  28.57 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  34.94 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  26 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  30.28 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  36.08 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  33.33 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  34 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5653  abortive infection protein  29.59 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.122774 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  44.44 
 
 		 453 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  34.57 
 
 		 198 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  31.03 
 
 		 211 aa  42  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>