70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0048 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  100 
 
 		 329 aa  646    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  39.8 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  38.08 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  40.38 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  42.52 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  39.81 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  40.38 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  39.35 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  38.89 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  35.8 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  38.81 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  40.93 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 233 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  30.47 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  35.5 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  35.87 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  26.92 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  34.11 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  30.58 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  30.74 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  30.92 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  29.8 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  32.6 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  29.66 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  29.88 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  30.25 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  31.09 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  30.41 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  32.16 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  28.75 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  27.04 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  29.29 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  26.42 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  31.01 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  31.55 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  27.62 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  27.22 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  30.26 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  30.26 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  27.85 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  29.26 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  31.62 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  40.86 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  31.2 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  25.32 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  30.89 
 
 		 182 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  30.3 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  29.73 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  24.17 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  38.96 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  33.63 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1345  abortive infection protein  33.33 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  36.36 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  36.36 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.65 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  37.76 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  34.21 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.85 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.65 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  35.62 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.62 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>