77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4219 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  100 
 
 		 296 aa  534  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  54.3 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  55.38 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  53.22 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  54.36 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  50 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  61.19 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  52.34 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  39.27 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  32.22 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  43.75 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  41.92 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  43.5 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  37.88 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  39.91 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  34.2 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  33.77 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  32.45 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  31.98 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  31.3 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  32.02 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  34.06 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  35.66 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  35.66 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  33.75 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  24.73 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  30.95 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  33.33 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  32.64 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  34.72 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  33.57 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  39.06 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  34.51 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  32.87 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  32.87 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  31.43 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  24.86 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  31.72 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  32.87 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  32.24 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  32.24 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  32.11 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  26.81 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  29.68 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  35.34 
 
 		 433 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  36.9 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  31.63 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  32.54 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.63 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  31.63 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  25 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  27.87 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  24.63 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.63 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  40.24 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  33.87 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  29.33 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  25.93 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  27.23 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.72 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  37.33 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  32.47 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  32.07 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  30 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  35.23 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  29.29 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5434  Abortive infection protein  34.31 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  0.0723746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.29 
 
 		 775 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.71 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  29.35 
 
 		 228 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  22.07 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  32.97 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>