41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1677 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0868  Abortive infection protein  33.62 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  26.51 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  26.07 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  26.06 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  23.08 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  32.46 
 
 		 298 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 298 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  24.37 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.67 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  27.35 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  26.67 
 
 		 314 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  27.35 
 
 		 311 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  27.35 
 
 		 311 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  31.21 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  26.67 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  26.67 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  25.2 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  27.35 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  28.41 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.5 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl564  CAAX amino terminal membrane bound protease  40.35 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00292167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  34.78 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000131903  normal  0.41258 
 
 
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  24.36 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16201  hypothetical protein  36.96 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.48 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  26.35 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  24.59 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 		 278 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  43.18 
 
 		 287 aa  42  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  34.15 
 
 		 267 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  24.31 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>