50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  66.25 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  53.94 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  51.46 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  50.21 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  49.37 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  50.63 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  49.37 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  50.21 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  50.21 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  48.95 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  48.95 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  47.7 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  45.83 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  46.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  45.97 
 
 		 286 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  44.81 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  45.45 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  46.25 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  44.58 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  45.15 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  43.04 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  41.91 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  45.87 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  43.04 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  47.15 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  43.28 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  44.73 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  44.21 
 
 		 437 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  43.42 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  39.31 
 
 		 293 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  51.9 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  43.56 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  38.13 
 
 		 295 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  40 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.87 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  34.95 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  37.25 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  31.87 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  29.52 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  26.88 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  32.94 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  23.81 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  31.68 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  36.67 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  37.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  34.48 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  34.48 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  24.32 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>