41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1424 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  70.85 
 
 
437 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  52.21 
 
 
267 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  52.14 
 
 
258 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  53.17 
 
 
286 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  53.39 
 
 
256 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  52.19 
 
 
256 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  49.24 
 
 
296 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  49.19 
 
 
260 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  48.13 
 
 
269 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  48.54 
 
 
282 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  51.03 
 
 
255 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  52.19 
 
 
269 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  49.79 
 
 
263 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  48.75 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  43.38 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  49.58 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  42.56 
 
 
277 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  49.81 
 
 
272 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  48.91 
 
 
242 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  46.77 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  44.81 
 
 
241 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  45.75 
 
 
255 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  41.89 
 
 
264 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  43.51 
 
 
295 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  42.51 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  43.32 
 
 
259 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  41.58 
 
 
302 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  42.91 
 
 
259 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  42.91 
 
 
259 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  43.32 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  43.32 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  42.74 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  40.77 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  35.87 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  24.87 
 
 
228 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  31.18 
 
 
120 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  26.25 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  34.15 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.72 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  34.15 
 
 
224 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>