52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1143 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  100 
 
 
256 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  84.86 
 
 
255 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  72.22 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  72.29 
 
 
257 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  74.42 
 
 
259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  72.29 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  72.29 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  74.81 
 
 
259 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  74.81 
 
 
259 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  54.58 
 
 
264 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  51.57 
 
 
268 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  51.46 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  47.47 
 
 
277 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  49.41 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  50.41 
 
 
286 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  47.28 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  46.67 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  47.06 
 
 
256 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  46.77 
 
 
273 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  44.72 
 
 
267 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  38.58 
 
 
260 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  45.63 
 
 
253 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  43.15 
 
 
269 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  43.9 
 
 
258 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  42.55 
 
 
293 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  42.11 
 
 
263 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  40.96 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  44.98 
 
 
296 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  56.33 
 
 
302 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  45.02 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  42.15 
 
 
269 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  47.77 
 
 
272 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  43.09 
 
 
437 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  35.85 
 
 
295 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  36.56 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.12 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  23.08 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  37.65 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  35.48 
 
 
120 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  25.78 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.91 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  28.99 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  32.56 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  34.78 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  33.56 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  31.58 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  33.63 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  28.57 
 
 
281 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  32 
 
 
242 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 
242 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>