21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4783 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  100 
 
 
317 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  48.86 
 
 
327 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  45.21 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  30.35 
 
 
319 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  27.52 
 
 
293 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  29.86 
 
 
314 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  22 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  22.92 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  31.82 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  25.82 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  35.87 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  36.46 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  28.99 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  28.45 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  33.96 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  28.35 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  24.69 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  33.75 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  25.19 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  34.78 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  32.1 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>