17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0130 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  48.78 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  38.16 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  32.39 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  26.85 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  30.61 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  36 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  25.82 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  40.86 
 
 		 419 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  30.07 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  28.8 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  31.49 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  36.11 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  23.98 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  33.98 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  31.86 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>