18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0061 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  48.78 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  40.47 
 
 
294 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  31.33 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  26.32 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  30 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  32 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  36.46 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  29.32 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  31.22 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  30.3 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  36.36 
 
 
419 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  34.78 
 
 
327 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  32.65 
 
 
400 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  31.2 
 
 
290 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  36.96 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  29.59 
 
 
386 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>