24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4640 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  100 
 
 
311 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  43.02 
 
 
419 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  30.51 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  36.46 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  27.88 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  32.22 
 
 
402 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  37 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  28.25 
 
 
386 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  29.82 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  30.66 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  24.43 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  41.18 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  34.58 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  27.47 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  28.87 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  38.21 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  35.06 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  27.73 
 
 
602 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  32.3 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  29.05 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  25 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  23.42 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  40.78 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  32.5 
 
 
220 aa  42.4  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>