52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3003 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  100 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  41.67 
 
 		 411 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  39.17 
 
 		 386 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  38.82 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  34.35 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  33.02 
 
 		 402 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  30.74 
 
 		 400 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  34.02 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  33.46 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  31.33 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  33.33 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  32.22 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  30.71 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  32.04 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  27.53 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  32.57 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  40 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  22.59 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  30.56 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  28.41 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  32.89 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  30.96 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  32 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  37.36 
 
 		 602 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  30.29 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  37.25 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  32.05 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  23.89 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  32 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  27.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  27.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  37.66 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  29.61 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  37.78 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  27.16 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.36 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.08 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  39.24 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  27.19 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.51 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  25.4 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.36 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  30.23 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  32.23 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.36 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  28.83 
 
 		 432 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  26.73 
 
 		 221 aa  42.7  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  25.98 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>