64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0340 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  376  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  51.06 
 
 
197 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  51.06 
 
 
197 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0262  Abortive infection protein  52 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229896  normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  49.21 
 
 
196 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0565  abortive infection protein  52.22 
 
 
193 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  48.98 
 
 
195 aa  175  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4721  abortive infection protein  50.84 
 
 
194 aa  158  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92863  predicted protein  32.5 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  34.75 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  27.38 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  27.38 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  27.38 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  27.38 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  27.98 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  27.98 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  26.79 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  30.15 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
308 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  26.35 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  39.33 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4926  Abortive infection protein  36.17 
 
 
198 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.866905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  36.78 
 
 
312 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  43.9 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  40.43 
 
 
225 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  32 
 
 
296 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  32.77 
 
 
528 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  29.25 
 
 
201 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  37.66 
 
 
301 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  36.04 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  31.78 
 
 
264 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
249 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  26.74 
 
 
253 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  26.74 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.74 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  35.42 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  29.63 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0437  Abortive infection protein  36.36 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  28.8 
 
 
420 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  36.04 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  36.04 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  25.17 
 
 
271 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.97 
 
 
297 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  25.58 
 
 
249 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1685  Abortive infection protein  30.89 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171064  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  40.51 
 
 
279 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  26.74 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  35.16 
 
 
267 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  34.12 
 
 
286 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  26.04 
 
 
286 aa  41.6  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
228 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  26.9 
 
 
251 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
228 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
228 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
228 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>