77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4723 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  100 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  52.99 
 
 		 269 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  51.26 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  31.02 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  28.69 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  28.95 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  38.38 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  33.63 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  38.54 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  38.54 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  26.98 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  29.14 
 
 		 480 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.71 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.71 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  28.99 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  39.6 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  29.71 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  28.99 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  28.94 
 
 		 527 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  28.94 
 
 		 527 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  39.18 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  28.07 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.95 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.31 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  28.99 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  27.95 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.17 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  25.15 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.17 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  34.83 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.56 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  24.56 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  24.56 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  31.43 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  29.68 
 
 		 527 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  33.65 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  27.48 
 
 		 538 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  31.73 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  27.35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  27.59 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  38.2 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  27.54 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  32.29 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  35.23 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  35.23 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  35.23 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2262  Abortive infection protein  37.63 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000165145  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  25.52 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  27.43 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  37.78 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  26.63 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  31.63 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  25.53 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  27.43 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  30.11 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  27.43 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0536  abortive infection protein  30 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  37.08 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  31.07 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  25.93 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  31.07 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  28.5 
 
 		 420 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  33.68 
 
 		 602 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  25.93 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  24.49 
 
 		 448 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  26.71 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  24.49 
 
 		 448 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  31.07 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  29.08 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>