120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0793 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  99.29 
 
 		 140 aa  274  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  52.09 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  43.96 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  43.96 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  43.96 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  43.41 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  43.96 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  36.36 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  34.97 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  37.38 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  35.78 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  38.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0016  surface exclusion protien  34.31 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  38.18 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  37.61 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  38.54 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  38.18 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  37.76 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  37.61 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.92 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  38.54 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.74 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  35.09 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  37.63 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  33 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  38.14 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  38.14 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31 
 
 		 313 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  38.14 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  32.63 
 
 		 337 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  32.63 
 
 		 337 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  31.78 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.13 
 
 		 480 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  29.69 
 
 		 453 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  31.93 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  34.78 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  35.79 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  37.5 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2555  abortive infection protein  32.79 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  34.82 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  36.84 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  36.73 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  35.04 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  38.3 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  35.48 
 
 		 432 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  35.42 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  35.71 
 
 		 602 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  35.42 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  34.38 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  28.21 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  40.96 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  32.56 
 
 		 448 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  38.14 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  33.96 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  32.54 
 
 		 448 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  35.64 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1048  Abortive infection protein  37.21 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.259406  normal  0.0219389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1585  Abortive infection protein  30.3 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  28.57 
 
 		 400 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  37.35 
 
 		 419 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  32.98 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  32.23 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  25.41 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09740  predicted metal-dependent membrane protease  38.82 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  34.48 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  36.17 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  33.01 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.2 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  25.68 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  25.68 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  31.48 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  29.69 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  28.57 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  35.51 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  33.61 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  33.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  27.47 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  26.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  38.2 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  34.91 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  36.04 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02730  Abortive infection protein  31.47 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  32.31 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  37.04 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1625  abortive infection protein  30.77 
 
 		 414 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>