110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1092 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  100 
 
 
284 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0698  Abortive infection protein  72.08 
 
 
244 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  38.33 
 
 
285 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  43.2 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  44 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  44 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  28.24 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  42.68 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.54 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  39.02 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  42.5 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  46.15 
 
 
420 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  42.86 
 
 
448 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  42.86 
 
 
448 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  46.15 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  37.8 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  34.07 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  41.25 
 
 
196 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  37.37 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.18 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  33.59 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  35.42 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  32.41 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.76 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  38.1 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  36.25 
 
 
180 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  29.67 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
216 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  29.01 
 
 
216 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.21 
 
 
396 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.47 
 
 
234 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  28.24 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  35.16 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  37.5 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  30.09 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  30.97 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  30.97 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  41.76 
 
 
453 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  30.71 
 
 
140 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  43.04 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  28.74 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  28.7 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.36 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  28.57 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.65 
 
 
337 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  37.78 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  34 
 
 
453 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  35.56 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  37.35 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.91 
 
 
313 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.65 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.91 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.65 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  31.25 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.65 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  30.21 
 
 
203 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.65 
 
 
337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.91 
 
 
313 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.65 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  42.53 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  38.64 
 
 
452 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  35.87 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  40.82 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  29.55 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  34.69 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  37.78 
 
 
362 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30.38 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  31.71 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  40.45 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  40.82 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  29.01 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  25.26 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  31.52 
 
 
203 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  31.52 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  31.52 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  27.37 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1579  Abortive infection protein  34.21 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.468328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  37.78 
 
 
480 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  35.8 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  27.59 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  36.78 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  26.83 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  39.76 
 
 
775 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2845  Abortive infection protein  35.44 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.957668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  38.46 
 
 
538 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  26.32 
 
 
237 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>