59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2730 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2730  putative inner membrane protein  100 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.148405  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2619  hypothetical protein  97.54 
 
 
203 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.313889  hitchhiker  0.000176774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2566  hypothetical protein  98.03 
 
 
203 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2517  caax amino protease family  97.04 
 
 
203 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2606  caax amino protease family  97.04 
 
 
203 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  43.41 
 
 
216 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  43.41 
 
 
216 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  42.41 
 
 
217 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  48.15 
 
 
140 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  39.8 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  39.8 
 
 
284 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  39.8 
 
 
282 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
284 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0166  CAAX amino protease  32.4 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  37.36 
 
 
284 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  37.76 
 
 
272 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  35.48 
 
 
282 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  33.33 
 
 
272 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  37.63 
 
 
265 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  33.64 
 
 
234 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  34 
 
 
346 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  34.51 
 
 
319 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  36.78 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0016  surface exclusion protien  31.65 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
337 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
337 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  35.05 
 
 
267 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 
337 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  36.56 
 
 
265 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.18 
 
 
313 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.18 
 
 
313 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  32.18 
 
 
337 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  33.71 
 
 
602 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  32.18 
 
 
337 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  29.01 
 
 
269 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  37.21 
 
 
277 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  38.04 
 
 
267 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0525  hypothetical protein  40.48 
 
 
255 aa  45.4  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.315028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  30.23 
 
 
238 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  29.67 
 
 
288 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  35.23 
 
 
273 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  37.08 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  37.08 
 
 
480 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  44.44 
 
 
528 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  34.88 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  33.72 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  30.48 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  30.11 
 
 
345 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  28.71 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  29.81 
 
 
176 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 
273 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  31.03 
 
 
306 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  28.83 
 
 
301 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>